Teste di serie
I due volte campioni europei del Boomerang sono una delle quattro teste di serie, cui si sono aggiunte le 12 squadre vincitrici del Main round, per poi formare quattro gironi. Nel Gruppo A, il Boomerang affronterà i padroni di casa dell'Arzignano nell'ultima partita del minitorneo. El Pozo Murcia FS, la squadra che ha portato il titolo spagnolo lontano da Madrid, è nel Gruppo D a Budapest e giocherà contro Futsal Club Gödöllö, FC Dorozhnik Minsk e Kairat Almaty, semifinalista 2005/06.
Dinamo
L'Action 21 Charleroi, che spera di risolvere presto i propri problemi finanziari e riconquistare la UEFA Futsal Cup vinta nel 2004/05, è nel Gruppo C con i padroni di casa del Clearex Chorzów, KMF Marbo Beograd e Araz Naxçivan. L'MFK Dinamo Moskva, battuta dallo Charleroi e dal Boomerang nelle ultime due finali, comincia dal Gruppo B contro FC Shakhtar Donetsk, Sporting Clube de Portugal e CIP Deva.
Final four
I minitornei di questa fase saranno giocati fra il 4 e il 10 dicembre. Solo le quattro squadre vincitrici di ogni girone approderanno alla fase Final Four che si terrà dal 26 al 28 aprile 2007. Non ancora decisa la squadra ospitante, che sarà comunque una delle quattro finaliste.
| Gruppo A (padroni di casa in grassetto) | | Boomerang Interviú (ESP), campione in carica | | Arzignano Grifo C/5 (ITA) | | MNK Split (CRO) | | CC LKW Jistebnik (CZE) |
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| Gruppo B | | MFK Dinamo Moskva (RUS) | | Sporting Clube de Portugal (POR) | | FC Shakhtar Donetsk (UKR) | | CIP Deva (ROU) |
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| Gruppo C | | Action 21 Charleroi (BEL) | | KMF Marbo Beograd (SRB) | | Araz Naxçivan (AZE) | | Clearex Chorzów (POL) |
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| Gruppo D | | El Pozo Murcia FS (ESP) | | FC Dorozhnik Minsk (BLR) | | Futsal Club Gödöllö (HUN) | | Kairat Almaty (KAZ) |
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