Sotto la direzione del segretario generale, l'amministrazione UEFA si occupa degli affari UEFA. Tra i suoi compiti c'è l'implementazione delle decisioni dei Congressi, delle conferenze, del Comitato Esecutivo e del presidente; la preparazione dei Congressi e delle conferenze, oltre che delle riunioni del Comitato Esecutivo e degli altri comitati; prendere nota di ciò che viene detto durante i Congressi e le conferenze, oltre che delle riunioni del Comitato Esecutivo e degli altri comitati; l'esecuzione degli affari operativi UEFA; tenere i registri della UEFA, e del lavoro di relazioni pubbliche.

L'amministrazione UEFA ha sede nella Casa del Calcio Europeo a Nyon, in Svizzera, che è stata inaugurata il 22 settembre 1999 e si è ufficialmente aperta ai lavori il 5 ottobre 1999. Dopo dieci anni, i membri dello staff UEFA presenti e passati si sono aggiunti agli ospiti per una cerimonia che ha celebrato un memorabile decennio.

Nell'ottobre 2010, è stata inaugurato un nuovo edificio amministrativo UEFA a Nyon, in Svizzera, durante una cerimonia alla quale hanno preso parte le 53 federazioni affiliate alla UEFA e il Comitato Esecutivo UEFA.

L'edificio La Clairière è di fronte alla Casa del Calcio Europeo, e permette alla UEFA di riunire alcuni membri del suo staff che precedentemente lavoravano in sedi diverse.

Di forma circolare, il nuovo edificio di quattro piani sposa gli standard ecologici e ambientali, e accoglie 230 membri dello staff. La prima pietra è stata posata nel gennaio 2009.

Un terzo edificio, Bois Bougy, sempre costruito con criteri ambientali in mente, è stato aperto nel marzo 2012. Un totale di 190 persone lavorerà nel nuovo edificio.

Nell'aprile del 2010, la UEFA ha sottolineato il legame con la città di Nyon assumendosi la gestione dello stadio Colovray proprio davanti al quartier generale della UEFA. Lo stadio comprende un campo da calcio principale - che è stato usato per l'allenamento da squadre di club e nazionali - oltre a una pista per l'atletica e un ristorante.

La UEFA utilizza il complesso Colovray per i suoi eventi, e ha anche organizzato un centro per la formazione dei giovani arbitri. La vita sportiva di Nyon sta sbocciando con club locali e associazioni sportive che stanno utilizzando queste strutture.